學院前身是1988年6月創辦的淮南鄉鎮企業職業學校；1990年1月更名為淮南科技職業學校；1993年3月，成立安徽工貿學校；2001年6月，成立安徽工貿職業技術學院，同時撤銷安徽工貿學院建制。

　　2013年9月，學院與淮南師范學院聯合培養“四年一貫制”應用型本科人才。

　　據2021年5月學院官網顯示，學院占地面積1200畝（含山南新校區規劃用地），校舍建筑面積14萬平方米，實驗儀器設備價值7000萬元；下設8個教學系部，開設64個專業，在校生5600人，專任教師400人。