首都醫科大學有良好的教學科研輔助設施，建有圖書館、檔案館、校史館、中心實驗室、實驗動物部、中醫研修學院及首都國醫名師館、校醫院等平臺。 學校十分重視國際、國內交流與合作，先后與美國、加拿大、澳大利亞、英國、瑞典、挪威、香港、臺灣等19個國家和地區的50多所高校和相關單位簽訂了友好交流合作協議。